Star Trek: Voyageri teine hooaeg tõstab panuseid, kui kapten Kathryn Janeway ja USS Voyageri meeskond kohtuvad uute liitlaste, ohtlike vaenlaste ja kosmiliste mõistatustega 70 000 valgusaasta kaugusel Maast.
Teisel hooajal kasvab meeskonnasisene pinge, kui Tähelaevastiku distsipliin ja Maquisi mässuliste otsekohesus omavahel põrkuvad. Samal ajal varjutavad teekonda reetlikud Kazonid ning salapärased kosmilised nähtused, mis panevad Voyageri vastupidavuse piirid proovile.
