Teisel hooajal süvenevad doktor House'i ja tema meeskonna (Chase, Cameron ja Foreman) vahelised pinged, kui juhtumid muutuvad üha keerukamaks. Hooaeg avab House'i tegelaskuju ja tema mineviku tagamaid, eriti tema suhteid endise elukaaslase Stacy Warneriga (Sela Ward). Samal ajal jälgitakse House'i pidevat võitlust kroonilise valu ja Vicodini-sõltuvusega.
